• facebook
  • linkedin
  • youtube
pankarta

Oinarrizko biologia molekularreko terminoen azalpena

Biologia Molekularreko kitak

1. cDNA eta cccDNA: cDNA mRNAtik alderantzizko transkriptasaren bidez sintetizatutako kate bikoitzeko DNA da;cccDNA kromosomarik gabeko kate bikoitzeko DNA zirkular itxia da.
2. Tolestura-unitate estandarra: proteina-egitura sekundarioko unitateak α-helizea eta β-xafla egitura-blokeak osatu ditzakete antolamendu geometriko bereziekin, konektatzeko hainbat polipeptidoren bidez.Tolestura zehaztu mota honi super bigarren mailako egitura deitzen zaio normalean.Ia hirugarren mailako egitura guztiak deskriba daitezke tolestura-mota hauek, eta baita haien mota konbinatuak ere, eta, beraz, toleste-unitate estandarrak ere deitzen zaizkie.
3. CAP: adenosina monofosfato ziklikoa (cAMP) proteina hartzailea CRP (cAMP hartzailea proteina), cAMP eta CRP konbinatu ondoren sortzen den konplexuari proteina aktibatzailea CAP (cAMP activated protein) deitzen zaio.
4. Sekuentzia palindromikoa: DNA zati baten segmentu baten alderantzizko sekuentzia osagarria, askotan murrizketa-entzimaren gunea.
5. micRNA: ARN interferentzia osagarria edo zentzuaren aurkako RNA, mRNA sekuentziaren osagarria dena eta mRNAren itzulpena galarazi dezakeena.
6. Erribozima: jarduera katalitikoa duen RNA, RNAren splicing-prozesuan eginkizun autokatalitikoa betetzen duena.
7. Motiboa: proteina molekulen egitura espazialean hiru dimentsioko forma eta topologia antzekoak dituzten tokiko eskualde batzuk daude.
8. Seinale-peptidoa: proteinen sintesian N-muturrean 15-36 aminoazido-hondakin dituen peptidoa, proteinaren transmintza gidatzen duena.
9. Atenuatzailea: transkripzioa amaitzen duen eragile-eskualde baten eta egitura-gene baten arteko nukleotido-sekuentzia.
10. Leku magikoa: bakterioak hazten direnean eta aminoazidoen gabezia osoa topatzen duenean, bakterioek larrialdi erantzun bat sortuko dute gene guztien adierazpena geldiarazteko.Larrialdi erantzun hori sortzen duten seinaleak guanosina tetrafosfatoa (ppGpp) eta guanosina pentafosfatoa (pppGpp) dira.PpGpp eta pppGpp-en eginkizuna ez da operoi bat edo batzuk bakarrik, horietako kopuru handi bati eragiten dio, beraz, supererregulatzaile edo puntu magikoak deitzen zaie.
11. Upstream elementu sustatzailea: sustatzailearen jardueran erregulazio-eginkizuna betetzen duen DNA-sekuentziari egiten dio erreferentzia, hala nola TATA -10 eskualdean, TGACA -35 eskualdean, indartzaileak eta atenuatzaileak.
12. DNA zunda: sekuentzia ezaguna duen DNAren segmentu etiketatua, sekuentzia ezezagunak detektatzeko eta xede-geneak pantailaratzeko asko erabiltzen dena.
13. SD sekuentzia: erribosomaren eta mRNAren lotura-sekuentzia da, itzulpena erregulatzen duena.
14. Antigorputz monoklonala: determinatzaile antigeniko bakar baten aurka bakarrik jarduten duen antigorputza.
15. Kosmidoa: artifizialki eraikitako DNA bektore exogeno bat da, fagoaren bi muturretan COS eskualdeak mantentzen dituena eta plasmidoari lotuta dagoena.
16. Leku urdin-zuriaren baheketa: LacZ genea (β-galaktosidasa kodetzen duena), entzimak X-gal (5-bromo-4-kloro-3-indol-β-D-galaktosidoa) substratu kromogenikoa deskonposa dezake urdina ekoizteko, horrela tentsioa urdin bihurtuz.DNA exogenoa sartzen denean, LacZ genea ezin da adierazi, eta tentsioa zuria da, bakterio birkonbinatzaileak pantailaratzeko.Horri pantaila zuri-urdina deitzen zaio.
17. Cis-eragileko elementua: Geneen adierazpena erregulatzen duen DNAko base-sekuentzia espezifikoa.
18. Klenow entzima: I DNA polimerasaren zati handia, 5' 3' exonukleasaren jarduera DNA polimerasa I holoentzimatik kentzen dela izan ezik.
19. PCR ainguratua: mutur batean sekuentzia ezaguna duen interesa duen DNA anplifikatzeko erabiltzen da.Sekuentzia ezezagunaren mutur batean poli-dG buztana gehitu zen, eta, ondoren, poli-dC eta sekuentzia ezaguna PCR anplifikaziorako abiarazle gisa erabili ziren.
20. Fusio proteina: proteina eukariotikoaren genea gene exogenoarekin lotuta dago, eta jatorrizko gene proteinaren eta proteina exogenoaren itzulpenaz osaturiko proteina aldi berean adierazten da.

Biologia molekularreko beste termino batzuk

1. DNAren mapa fisikoa DNA molekularen zatiak (murrizketa-endonukleasa bidez digerituak) ordenatzen diren ordena da.
2. RNasaren zatiketa bi motatan banatzen da (autokatalisia) eta (heterokatalisia).
3. Prokariotoetan hiru hasierako faktore daude (IF-1), (IF-2) eta (IF-3).
4. Mintzaz gaindiko proteinek orientazioa behar dute (seinale-peptidoak), eta proteina-txaperonen eginkizuna (peptido-katea proteinaren jatorrizko konformazioan tolesten laguntzen du).
5. Sustatzaileetako elementuak, orokorrean, bi motatan bana daitezke: (elementu sustatzaile nagusiak) eta (elementu sustatzaileak upstream).
6. Biologia molekularraren ikerketa-edukiak hiru zati ditu nagusiki: (biologia molekular estrukturala), (geneen adierazpena eta erregulazioa) eta (DNA birkonbinazio teknologia).
7. DNA material genetikoa dela frogatzen duten bi esperimentu nagusiak hauek dira (saguen pneumokokoaren infekzioa) eta (Escherichia coliren T2 fagoen infekzioa).potentziala).
8. Bi desberdintasun nagusi daude hnRNA eta mRNAren artean: (hnRNA mRNA bihurtzeko prozesuan splize egiten da), (mRNAren 5' muturra m7pGppp kaparekin gehitzen da, eta ARNm azidoaren (poliA) isatsaren 3' muturrean poliadenilazio gehigarria dago).
9. Azpiunitate anitzeko proteina formaren abantailak hauek dira (azpiunitatea DNA erabiltzeko metodo ekonomikoa da), (proteinen sintesian ausazko akatsek proteinen jardueran duten eragina murriztu dezakete), (jarduera oso eraginkor eta azkar ireki eta ixten da).
10. Proteinen tolesketa-mekanismoaren lehen nukleazio teoriaren eduki nagusia (nukleazioa), (egitura-aberastea) (azken berrantolaketa) barne hartzen du.
11. Galaktosak eragin bikoitza du bakterioetan;alde batetik (zelulen hazkuntzarako karbono iturri gisa erabil daiteke);bestetik (zelula hormaren osagaia ere bada).Hori dela eta, cAMP-CRP-en S2 sustatzaile independentea behar da hondo mailan sintesi iraunkorra egiteko;aldi berean, cAMP-CRP-ren menpeko S1 sustatzaile bat behar da goi-mailako sintesia erregulatzeko.Transkripzioa (S2) G-rekin hasten da eta (S1) G gabe.
12. DNA birkonbinatuaren teknologia (geneen klonazioa) edo (klonazio molekularra) izenez ere ezagutzen da.Azken helburua da (organismo bateko informazio genetikoa DNA beste organismo batera transferitzea).ADN birkonbinazio esperimentu tipiko batek urrats hauek izan ohi ditu: (1) Organismo emailearen xede-genea (edo gene exogenoa) atera, eta entzimatikoki konektatu beste DNA molekula batekin (klonazio-bektorea) DNA birkonbinatzaile molekula berri bat osatzeko.② DNA birkonbinatzailea zelula hartzailera transferitzen da eta zelula hartzailean errepikatzen da.Prozesu honi eraldaketa deitzen zaio.③ Aztertu eta identifikatu DNA birkonbinatzailea xurgatu duten zelula hartzaileak.④Landu DNA birkonbinatzailea duten zelulak kantitate handitan, atzerriko laguntzaren genea adierazten den ala ez detektatzeko.
13. Plasmidoen erreplikazioa bi mota daude: zelula ostalariaren proteinen sintesiak zorrotz kontrolatzen dituenei (plasmido estuak) deitzen zaie, eta ostalari zelulen proteinaren sintesiak zorrotz kontrolatzen ez dituztenei (plasmido erlaxatuak).
14. PCR erreakzio-sistemak baldintza hauek izan behar ditu: a.Bereizi nahi den xede-genearen bi kateen mutur bakoitzean sekuentzia osagarriak dituzten DNA abiarazleak (20 base inguru).b.Egonkortasun termikoa duten entzimak, hala nola: TagDNA polimerasa.c, dNTPd, txantiloi gisa interesgarria den DNA sekuentzia
15. PCRren oinarrizko erreakzio-prozesuak hiru fase ditu: (desnaturalizazioa), (errekuntza) eta (hedapena).
16. Animalia transgenikoen oinarrizko prozesuak honako hauek izan ohi ditu: ①Klonatutako gene arrotza sartzea ernaldutako arrautza edo enbrioi-zelula ama baten nukleoan;②Inokulatutako arrautza ernaldua edo enbrioi-zelula ama emakumearen umetokian transplantatzea;③Enbrioiaren garapena eta hazkuntza osoa gene arrotzak dituzten ondorengoentzat;④ Erabili proteina arrotzak ekoitzi ditzaketen animalia hauek hazkuntza gisa, lerro homozigoto berriak hazteko.
17. Hibridoma zelula-lerroak (spleen B) zelulak (mieloma) zelulekin hibridatuz sortzen dira, eta (espleen-zelulek) hipoxantina erabil dezaketenez eta (hezur-zelulek) zelulen zatiketa funtzioak ematen dituztenez, HAT medioan hazi daitezke.hazi.
18. Ikerketan sakontzearekin batera, lehenengo belaunaldiari (antigorputz poliklonalak), bigarren belaunaldiari (antigorputz monoklonalak) eta hirugarren belaunaldiari (ingeniaritza genetikoko antigorputzak) deitzen zaio.
19. Gaur egun, intsektuen birusen ingeniaritza genetikoa bakulobirusetan oinarritzen da batez ere, hau (toxina exogenoaren genea) sartzean agertzen dena;(intsektuen bizi-ziklo normala hausten duten geneak);(birusen geneen aldaketa).
20. Ugaztunen RNA polimerasa II sustatzailean TATA, GC eta CAAT elementu komunei dagozkien trans-eragile proteina-faktoreak (TFIID), (SP-1) eta (CTF/NF1) dira, hurrenez hurren.
hogeita bat.Ⅱ ARN polimerasaren oinarrizko transkripzio-faktoreak hauek dira: TFⅡ-A, TFⅡ-B, TFII-D, TFⅡ-E, eta hauen lotura-sekuentzia: (D, A, B, E).Non TFII-D-ren funtzioa (TATA kutxarekin lotzea) den.
hogeita bi.DNAri lotzen zaizkion transkripzio-faktore gehienek dimero moduan funtzionatzen dute.DNArekin lotzen diren transkripzio-faktoreen domeinu funtzionalak hauek dira normalean (helize-bira-helize), (zink hatz motiboa), (oinarrizko-leuzina) kremailera motiboa).
hogeita hiru.Hiru motatako murrizketa-endonukleasa ebakitzeko moduak daude: (simetria ardatzaren 5' aldean moztu 5' mutur itsaskorrak sortzeko), (simetria ardatzaren 3' aldean moztu 3' mutur itsaskorrak sortzeko (simetria ardatzean moztu segmentu lauak sortzeko) ).
hogeita lau.DNA plasmidoak hiru konfigurazio ezberdin ditu: (SC konfigurazioa), (oc konfigurazioa), (L konfigurazioa).Elektroforesian lehenengoa (SC konfigurazioa) da.
25. Gene-adierazpen-sistema exogenoak, batez ere (Escherichia coli), (Legamia), (Intsektua) eta (Ugaztun-zelulen taula).
26. Animalia transgenikoentzako erabili ohi diren metodoak hauek dira: (infekzio erretrobiralaren metodoa), (ADN mikroinjekzioaren metodoa), (enbrioi-zelula amaren metodoa).

Aplikazioa Biologia molekularra

1. Izendatu 5 RNA baino gehiagoren funtzioak?
Transfer RNA tRNA Transfer aminoazido Erribosomaren RNA rRNA Erribosomak ARN mezularia osatzen du mRNA Proteinen sintesi txantiloia ARN nuklear heterogeneoa hnRNA ARN nuklear helduaren aitzindaria ARN ARN nuklear txikiaren aitzindaria hnRNA splicing-ean parte hartzen du ARN zitoplasmiko txikia scRNA/7SL-RNA proteina Plasma erretikuluaren osagaiak erretikulu-zentzuduna eta ARN lokalizatua erregulazio-seinalea adierazpena Ribozyme RNA Entzimatikoki aktiboa den RNA
2. Zein da sustatzaile prokariotoen eta eukariotoen arteko desberdintasun nagusia?
TTGACA prokariotikoa --- TATAAT------Hasiera Gune-35 -10 Eukaryotic Enhancer---GC ---CAAT----TATAA-5mGpp-Hasiera Gune-110 -70 -25
3. Zeintzuk dira plasmido naturalen eraikuntza artifizialaren alderdi nagusiak?
Plasmido naturalek askotan akatsak izaten dituzte, beraz, ez dira egokiak ingeniaritza genetikorako eramaile gisa erabiltzeko, eta aldatu eta eraiki behar dira: a.Gehitu hautapen-markatzaile-gene egokiak, adibidez, bi edo gehiago, hautatzeko errazak direnak, normalean antibiotiko geneak.b.Entzimak mozteko gune egokiak handitu edo txikitu birkonbinazioa errazteko.c.Luzera laburtu, alferrikako zatiak moztu, inportazio-eraginkortasuna hobetu eta karga-ahalmena handitu.d.Aldatu erreplikoia, estutik soltera, kopia gutxiagotik kopia gehiagotara.e.Gehitu elementu genetiko bereziak ingeniaritza genetikoaren eskakizun berezien arabera
4. Eman adibide bat ehunen cDNA espezifikoen baheketa diferentziala egiteko metodo bat?
Bi zelula-populazio prestatzen dira, xede-genea zeluletako batean adierazten da edo oso adierazten da, eta xede-genea ez da beste zelula batean adierazten edo gutxi adierazten, eta, ondoren, xede-genea hibridazio eta konparazio bidez aurkitzen da.Adibidez, tumoreen agerpenean eta garapenean, tumore-zelulek zelula arruntek baino adierazpen maila desberdinak dituzten mRNAk aurkeztuko dituzte.Hori dela eta, tumoreekin erlazionatutako geneak hibridazio diferentzialaren bidez deuseztatu daitezke.Indukzio-metodoa ere erabil daiteke haien adierazpena induzitzen den geneak ezabatzeko.
5. Hibridoma zelula-lerroen sorrera eta baheketa?
B zelulak + mieloma zelulak, gehitu polietilenglikola (PEG) zelulen fusioa sustatzeko, eta HAT medioan hazitako B-mieloma fusio-zelulek (hipoxantina, aminopterina, T dutenak) elikatzen jarraitzen dute.Zelula-fusioak honako hauek ditu: bazea eta bazea fusio-zelulak: ezin dira hazi, barearen zelulak ezin dira in vitro hazi.Hezur-hezurretako fusio-zelulak: ezin dute hipoxantina erabili, baina bigarren bidetik purina sintetiza dezakete folato erreduktasa erabiliz.Aminopterinak folato reductasa inhibitzen du eta, beraz, ezin da hazi.Hezur-spleen fusio-zelulak: HAT-n hazi daitezke, barearen zelulek hipoxantina erabil dezakete eta hezur-zelulek zelula-zatiketa funtzioa ematen dute.
6. Zein da DNAren egitura primarioa zehazteko dideoxy terminal-metodoaren bidez (Sanger metodoa) zehazteko printzipioa eta metodoa?
Printzipioa nukleotido-katearen amaierako 2,,3,-didesoxinukleotido bat erabiltzea da DNAren hedapena amaitzeko.3/5/fosfodiester loturak eratzeko behar den 3-OH falta duenez, DNA katean sartu ondoren, DNA katea ezin da gehiago luzatu.Base parekatzearen printzipioaren arabera, DNA polimerasak normalean hedatutako DNA katean parte hartzeko dNMP behar duen bakoitzean, bi aukera daude, bata ddNTPn parte hartzea da, eta horrek desoxinukleotidoen katearen luzapena amaitzen du;bestea dNTPn parte hartzea da, DNA katea oraindik ere luzatzen jarrai dezan hurrengo ddNTP sartu arte.Metodo honen arabera, ddNTP-z amaitzen diren luzera ezberdineko DNA zati talde bat lor daiteke.Metodoa lau taldetan banatzea da, hurrenez hurren ddAMP, ddGMP, ddCMP eta ddTMP.Erreakzioaren ondoren, poliakrilamida gelaren elektroforesiak DNAren sekuentzia irakur dezake igeriketa-banden arabera.
7. Zein da proteina aktibatzaileak (CAP) erregulazio positiboak transkripzioan?
Adenilato ziklikoa (cAMP) hartzaile proteina CRP (cAMP hartzailearen proteina), cAMP eta CRP konbinatuz sortutako konplexuari CAP (cAMPactivated protein) deitzen zaio.E. coli glukosarik gabeko euskarri batean hazten denean, CAParen sintesia handitzen da, eta CAP-ak laktosa (Lac) bezalako sustatzaileak aktibatzeko funtzioa du.CRPren menpeko sustatzaile batzuek ez dute sustatzaile arruntek duten -35 eskualde-sekuentzia-ezaugarri tipikoa (TTGACA).Horregatik, zaila da RNA polimerasa harekin lotzea.CAP (funtzioa) egotea: entzimaren eta sustatzailearen lotura-konstantea nabarmen hobetu dezake.Batez ere, honako bi alderdi hauek erakusten ditu: ① CAP entzimaren molekula zuzen orientatzen laguntzen du, sustatzailearen konformazioa eta entzimarekiko elkarrekintza aldatuz, horrela -10 eskualdearekin konbinatzeko eta -35 eskualdearen funtzioa ordezkatzeko papera betetzeko.②CAPek RNA polimerasa DNAko beste gune batzuetara lotzea ere inhibi dezake, eta horrela bere sustatzaile espezifikoarekin lotzeko probabilitatea areagotu dezake.
8. Zein urrats sartu ohi dira DNA birkonbinazio esperimentu tipiko batean?
a.Organismo emailearen xede-genea (edo gene exogenoa) atera, eta entzimatikoki konektatu beste DNA molekula batekin (klonazio-bektorea) DNA birkonbinatzaile molekula berri bat osatzeko.b.Transferitu DNA molekula birkonbinatzailea hartzaile zelulara eta erreplikatu eta kontserbatu hartzaile zelula.Prozesu honi eraldaketa deitzen zaio.c.Aztertu eta identifikatu DNA birkonbinatzailea xurgatu duten zelula hartzaileak.d.ADN birkonbinatzailea duten zelulak masiboki hazten dira, atzerriko laguntzaren genea adierazten den ala ez detektatzeko.
9. Geneteka eraikitzea Errekonbinatzaileen baheketa egiteko hiru metodo ematen dira eta prozesua laburki deskribatzen da.
Antibiotikoen erresistentzia baheketa, erresistentziaren txertatze inaktibazioa, puntu zuri-urdinen baheketa edo PCR baheketa, baheketa diferentziala, DNA zunda Klonazio-bektore gehienek antibiotikoen erresistentzia geneak daramatzate (anti-anpizilina, tetraziklina).Plasmidoa Escherichia colira transferitzen denean, bakterioek erresistentzia lortuko dute, eta transferentziarik ez dutenek ez dute erresistentziarik izango.Baina ezin du bereizi berrantolatu den ala ez.Bi erresistentzia-gene dituen bektore batean, DNA zati arrotz bat geneetako batean txertatzen bada eta genea inaktibatzea eragiten badu, botika desberdinak dituzten bi plaka-kontrol erabil daitezke birkonbinatzaile positiboak bilatzeko.Esate baterako, pUC plasmidoak LacZ genea dauka (β-galaktosidasa kodetzen duena), X-gal (5-bromo-4-chloro-3-indole-β-D-galaktosidoa) substratu kromogenikoa deskonposatu dezakeena urdina sortzeko, tentsioa urdin bihurtuz.DNA arrotza txertatzen denean, LacZ genea ezin da adierazi, eta tentsioa zuria da, bakterio birkonbinatzaileak pantailaratzeko.
10. Azaldu zein den enbrioi-zelula amaren bidez animalia transgenikoak lortzeko oinarrizko prozesua?
Enbrioi-zelula amak (ES) enbrioi-zelulak dira enbrioi-garapenean, artifizialki hazi eta ugal daitezke eta beste zelula mota batzuetan bereizteko funtzioa dute.ES zelulen kultura: Blastozistoaren barneko zelulen masa isolatu eta hazten da.ES elikadurarik gabeko geruza batean hazten denean, hainbat zelula funtzionaletan bereiziko da, hala nola muskulu-zelulak eta N zelulak.Fibroblastoak dituen medio batean hazten denean, ES bereizketa funtzioari eutsiko dio.ES genetikoki manipulatu daiteke, eta bere bereizketa-funtzioa bere diferentziazio-funtzioari eragin gabe integra daiteke, eta horrek ausazko integrazioaren arazoa konpontzen du.Sartu gene exogenoak enbrioi-zelula ametan, gero haurdun dauden sagu emeen umetokian txertatu, kume bihurtu eta gurutzatu sagu homozigotoak lortzeko.