• facebook
  • linkedin
  • youtube

SARS-CoV-2 agerpena B.1.1.7 Leinua

Estatu Batuak, 2020ko abenduaren 29a2021eko urtarrilaren 12a

Summer E. Galloway, doktoretza 1;Prabasaj Paul, doktore 1;Duncan R. MacCannell, doktoregoa 2;Michael A. Johansson, doktore 1;

John T. Brooks, MD 1;Adam MacNeil, doktore 1;Rachel B. Slayton, doktorea 1;Suxiang Tong, doktore 1;Benjamin J. Silk, doktore 1;Gregory L. Armstrong, MD 2;

Matthew Biggerstaff, ScD 1;Vivien G. Dugan, doktorea

2021eko urtarrilaren 15ean, txosten hau MMWR gisa argitaratu zenArgitalpen goiztiarra MMWR webgunean (https://www.cdc.gov/mmwr).

2020ko abenduaren 14an, Erresuma Batuak jakinarazi zuenSARS-CoV-2 kezkaren aldaera (COV), B.1.1.7 leinua,VOC 202012/01 edo 20I/501Y.V1 ere deitzen zaio.*B.1.1.7 aldaera irailean sortu zela uste da2020 eta azkar bihurtu da zirkulatzaile nagusienaSARS-CoV-2 aldaera Ingalaterran (1).B.1.1.7 izan da30 herrialde baino gehiagotan detektatu dute, Estatu Batuetan barne.As2021eko urtarrilaren 13koa, B.1.1.7ko 76 kasu gutxi gorabeheraAEBetako 12 estatutan atzeman da.Froga-lerro anitzadierazi B.1.1.7 baino eraginkorrago transmititzen delaSARS-CoV-2 beste aldaera batzuk (13).-ren modelatutako ibilbideaAEBetako aldaera honek hazkunde azkarra izan du 2021 hasieran,martxoan aldaera nagusi bilakatuz.HandituSARS-CoV-2 transmisioak osasun arreta estua mehatxatu dezakebaliabideak, ezarpen hedatu eta zorrotzagoa eskatzen duteosasun publikoko estrategien (4), eta ehunekoa handitupandemia kontrolatzeko beharrezkoa den populazioaren immunitatea.Hartuzorain transmisioa murrizteko neurriek potentziala gutxitu dezaketeB.1.1.7ren eragina eta txertoa handitzeko denbora kritikoa emanzio-estaldura.Kolektiboki, zaintza genomikoaren hobekuntzapubliko eraginkorra etengabe betetzearekin bateraosasun neurriak, besteak beste, txertoa, distantzia fisikoa,maskarak erabiltzea, eskuen higienea eta isolamendua eta berrogeialdia egingo diraezinbestekoa izan SARS-CoV-2 birusaren hedapena mugatzekokoronavirus gaixotasuna eragiten duena 2019 (COVID-19).Estrategikoasintomarik gabeko pertsonei probak egitea, baina arrisku handiagoa dutenakinfekzioa, esate baterako, SARS-CoV-2-ren eraginpean daudenek edo dutenekpublikoarekin maiz saihestezina den harremana, beste bat eskaintzen duetengabeko hedapena mugatzeko aukera.

Zaintza genomiko globala eta kode irekiko shar bizkorragenomaren sekuentziak biralak denbora errealean ia erraztu duSARS-CoV-2 bilakaeraren detekzioa, alderaketa eta jarraipenaosasun publikoa kontrolatzeko ahaleginen berri izan dezaketen aldaerakpandemia.Aldiz, genoma birikoaren mutazio batzukazaleratu eta gero atzera egin, beste batzuek aurrerapen selektiboa eman dezaketealdaerara, transmisigarritasun hobetua barne, berazaldaera horrek azkar menderatu ditzake zirkulazioko beste aldaera batzuk.

Pandemiaren hasieran, SARS-CoV-2 duten aldaerakhanditzen den spike (S) proteinan D614G mutazioaerrezeptoreen lotzeko avidtasuna azkar nagusitu zen askotaneskualde geografikoak (5,6).2020ko udazken amaieran, hainbat herrialdek detektatu zutenEraginkorrago zabaltzen diren SARS-CoV-2 aldaerak.GaineraB.1.1.7 aldaerari, aldaera aipagarrien artean B.1.351Hegoafrikan detektatu zen lehen leinua eta identifikatu berri duenaB.1.1.28 azpikladea (izendatuaP.1) lau bidaiaritan atzeman daBrasiletik Hanedan (Tokio) ohiko emanaldianaireportua.§ Aldaera hauek muta genetikoaren konstelazio bat daramatezioek, S proteinaren hartzaileak lotzeko domeinuan barne,ezinbestekoa den angiotensina ostalariaren zelularekin lotzeko.entzima-2 (ACE-2) hartzaile bihurtzea birusa erraztekosarrera.Ebidentziek iradokitzen dute beste mutazio batzuk aurkitu dituztela hauetanaldaerek transmitigarritasuna areagotzeaz gaindenbora errealeko diagnostiko batzuen errendimenduari ere eragin diezaiokealderantzizko transkripzioapolimerasaren kate erreakzioa (RT-PCR)entseguaketa antigorputz neutralizatzaileekiko suszeptibilitatea murriztea(2,3,510).Azken kasuaren txosten batek lehen kasua dokumentatu zuenSARS-CoV-2 berriro infekzioa Brasilen SARS-CoV-2 aldaera batekinhorrek E484K mutazioa zuen,** erakutsi denaneutralizazioa murrizteko sero konbaleszenteak eta monoklonalakantigorputzak (9,10).

Txosten honek B.1.1.7 aldaeraren sorreran zentratzen daEstatu Batuetan.2021eko urtarrilaren 12tik aurrera, ezB.1.351 ezta P.1 aldaerak detektatu diraAmeriketako Estatu Batuak.Sortzen ari den SARS-CoV-2ri buruzko informazioa lortzekokezkaren aldaerak, CDCk horri eskainitako web orria mantentzen dusortzen ari diren SARS-CoV-2 aldaerei buruzko informazioa ematea.††

 B.1.1.7 leinua (20I/501Y.V1)

B.1.1.7 aldaerak mutazio bat darama S proteinan(N501Y) hartzaile-loturaren konformazioari eragiten dionadomeinua.Aldaera honek beste 13 B.1.1.7 leinu-mutazio definitzen ditu (Taula), eta horietako batzuk S proteinan daude,69. eta 70. posizioetan ezabatzea barne (del6970) horiberez eboluzionatu zuen beste SARS-CoV-2 aldaeretan eta datransmitigarritasuna areagotzeko hipotesia (2,7).Ezabapena69. eta 70. posizioetan S-genearen xede-hutsegitea (SGTF) eragiten dugutxienez RT-PCR bateanoinarritutako diagnostiko-saiakuntza (hau da,ThermoFisher Taq Path COVID-19 saiakera, B.1.1.7 aldaeraant eta del69rekin beste aldaera batzuk70 negatiboa sortzen duemaitza S-gene helbururako eta emaitza positiboa beste bientzathelburuak);SGTF proxy gisa aritu da Erresuma BatuanB.1.1.7 kasuak identifikatzeko (1).Froga-lerro anitzek B.1.1.7 gehiago dela adierazten duteeraginkortasunez transmititzen da beste SARS-CoV-2 batzuekin alderatutaErresuma Batuan zirkulatzen ari diren aldaerak.Erresuma Batuko eskualdeekinB.1.1.7 sekuentzien proportzio handiagoak epidemia azkarragoa izan zuenbeste arlo batzuek baino hazkundea, SGTF-ren diagnostikoak areagotu egin zirenEremu berdinetan SGTF ez diren diagnostikoak baino azkarrago, eta akontaktuen proportzio handiagoa indizeko pazienteek kutsatu zutenB.1.1.7 infekzioekin kutsatutako gaixo indizeek bainobeste aldaera batzuk (1,3).B.1.1.7 aldaerak AEBetako pantaila handitzeko aukera dudemikoaren ibilbidea datozen hilabeteetan.Efektu hori adierazteko,konpartimentu-eredu sinple eta bi aldaera garatu zen.AEBetako B.1.1.7ren egungo prebalentzia zirkulatzen duten guztien arteanbirusak ezezagunak dira, baina uste da %0,5 <0,5 deladetektatu diren kasu kopuru mugatua eta SGTF datuak (8).Izan ereereduan, hasierako hipotesiek B.1.1.7 prebalentzia barne hartzen zuten% 0,5 infekzio guztien artean, SARS-CoV-2 immunitateaaurreko infekzioa % 10ekoa%30, denboraren arabera aldakorra den ugalketa1,1eko zenbakia (R t ) (transmisio arindua baina areagotuz)edo 0,9 (gutxiago transmisioa) egungo aldaeretarako, eta egunean 100.000 pertsonako 60 kasuko intzidentzia jakinarazi dute.2021eko urtarrilaren 1a. Suposizio hauek ez dute zehazki adieraztenAEBetako edozein kokapen bakarra, baizik eta orokortzea adieraziherrialde osoan ohikoak diren baldintzak.R t-ren aldaketaeskuratutako immunitatearen ondorioz eta preva handituz doan denboraB.1.1.7ren lentzia modelatu zen, B.1.1.7 R t hartuz.uneko aldaeren R t-aren 1,5 aldiz konstantea izatea, oinarritzat hartutaErresuma Batuko hasierako estimazioak (1,3).Jarraian, txertoaren balizko eragina modelatu zenbakoitzeko milioi bat txerto-dosi eman zirela suposatuz2021eko urtarrilaren 1eko eguna eta %95eko immunitate hori2 dosi jaso eta 14 egun igaro ondoren lortu zen.Zehazki,infekzioaren aurkako immunitatea egungo aldaerekin edoB.1.1.7 aldaera suposatu zen, nahiz eta eraginkortasuna etainfekzioen aurkako babesaren iraupena ez da ziurra izaten,horiek ez zirelako entsegu klinikoen azken puntu nagusiahasierako txertoetarako.Eredu honetan, B.1.1.7 prebalentzia hasieran baxua da, hala ereegungo aldaerak baino transmitigarriagoa da, erakusten duhazkunde azkarra 2021 hasieran, barietate nagusi bihurtuzinurri martxoan (1. irudia).Ea korrontearen transmisioaaldaerak handitzen ari dira (hasierako R t = 1,1) edo poliki-poliki gutxitzen ari da(hasierako R t = 0,9) urtarrilean, B.1.1.7 aldaketa nabarmena eragiten dutransmisio-ibilbidean eta esponentzialaren fase berri bathazkundea.Infekziotik babesten duen txertoarekin,epidemiaren hasierako ibilbideak ez dira aldatzen eta B.1.1.7 hedatzen diraoraindik gertatzen da (2. irudia).Hala ere, B.1.1.7 bihurtu ondorenaldaera nagusi, bere transmisioa nabarmen murriztu zen.Txertoak hurbileko transmisioa murrizteko duen eraginaepe handiena transmisioa izan zen eszenatokian izan zendagoeneko gutxitzen ari da (hasierako R t = 0,9) (2. irudia).Lehen ahaleginak horiB.1.1.7 aldaeraren hedapena muga dezake, hala nola unibertsala etaosasun publikoa arintzeko estrategiak betetzea areagotzea,denbora gehiago emango du etengabeko txertoa handiagoa lortzekopopulazio mailako immunitatea.

Eztabaida

Gaur egun, ez dago desberdintasunik emaitza klinikoetandeskribatutako SARS-CoV-2 aldaerekin lotuta;hala ere,transmisio-tasa handiagoak kasu gehiago ekarriko ditu, handituzarreta klinikoa behar duten pertsonen kopurua, oro har, areagotuDagoeneko tentsioa duen osasun-sistema baten zama murriztea,eta heriotza gehiago eraginez.Zaintza genomiko jarraituaB.1.1.7 kasuak identifikatzea, baita beste batzuen agerpena ereEstatu Batuetako kezka aldaerak, garrantzitsua daCOVID-19 osasun publikoaren erantzuna.SGTF emaitzak, berrizkonfirmatu daitezkeen balizko B.1.1.7 kasuak identifikatzen lagun dezakesekuentziatuz, erakusten ez duten lehentasunezko aldaerak identifikatuzSGTF sekuentzian oinarritutako zaintzan oinarritzen da soilik.

 

 

 

Aldaera izendapena

Lehen identifikazioa  

Mutazio ezaugarriak

(proteina: mutazioa)

Uneko sekuentziaz baieztatutako kasuen kopurua zk

dituzten herrialdeak

sekuentziak

Kokapena Data Ameriketako Estatu Batuak Mundu osoan  
B.1.1.7 (20I/501Y.V1) Erresuma Batua 2020ko iraila ORF1ab: T1001I, A1708D, I2230T,

del36753677 SGF

S: del6970 HV, del144 Y, N501Y,

A570D, D614G, P681H, T761I,

S982A, D1118H

ORF8: Q27stop, R52I, Y73C

N: D3L, S235F

76 15.369 36
B.1.351 (20H/501Y.V2) Hegoafrika 2020ko urria ORF1ab: K1655N

E: P71L

N: T205I

S:K417N, E484K, N501Y, D614G,

A701V

0 415 13

 

P.1 (20J/501Y.V3 Brasil eta Japonia 2021eko urtarrila ORF1ab: F681L, I760T, S1188L,

K1795Q, del36753677 SGF, E5662D

S: L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S,

K417T, E484K, N501Y, D614G,

H655Y, T1027I

ORF3a: C174G

ORF8: E92K

ORF9: Q77E

ORF14: V49L

N: P80R

0 35 2

 

Laburdurak: del = ezabaketa;E = kartazal-proteina;N = nukleokapside proteina;ORF = irakurketa marko irekia;S = piko proteina.

Erresuma Batuko esperientzia eta B.1.1.7 ereduaktxosten honetan aurkeztutako inpaktua kutsakorragoa erakusten dutealdaerak populazio bateko kasu kopuruan izan dezake.Thealdaera honen transmisigarritasuna are gehiago eskatzen dutxertoa eta mitigaren ezarpen konbinatua zorrotzaneurriak (adibidez, urruntzea, maskaratzea eta eskuen higienea)SARS-CoV-2 hedapena kontrolatzeko.Neurri hauek izango diraeraginkorragoak dira lehenago baino beranduago ezartzen badiraB.1.1.7 aldaeraren hasierako hedapena moteltzeko.Ahaleginakprestatzeko osasun-sistema gorakada gehiago kasuetan dirabermatuta.Transmisioa handitzeak hori ere handiagoa dakaraurreikusitakoa baino txerto-estaldura lortu behar dagaixotasunen kontrol-maila bera lortzea publikoa babestekotransmisio gutxiagoko aldaerekin alderatuta.akademia, industria, estatu, lurralde,tribu eta tokiko bazkideak, CDC eta beste agentzia federal batzukzaintza genomikoa koordinatzen eta hobetzen ari dira etaEstatu Batuetan birusak karakterizatzeko ahaleginak.CDCAEBetako sekuentziazio ahaleginak koordinatzen ditu SARS-CoV-2ren bidezOsasun Publikoko Larrialdiei Erantzuteko sekuentziazioa,Epidemiologia eta Zaintza (ESFERAK)§§partzuergoa,Parte hartzen duten 170 erakunde inguru biltzen dituena eta SARS-CoV-2-ren erabilera errazteko datu irekiak partekatzea sustatzen duena.sekuentzia datuak.SARS-CoV-2 biralaren bilakaera jarraitzeko, CDC dazaintza genomiko anitzekoa ezartzea ulertzekoprozesu epidemiologikoak, immunologikoak eta eboluzio-prozesuakfilogenia birikoak (filodinamika) eratzen dituztenak;gidari agerraldiaikerketak;eta antzematea eta karakterizazioa erraztubirinfekzio posibleen zioa, txertoaren aurrerapen kasuak etasortzen ari diren aldaera birikoak.2020ko azaroan, CDC sortu zenSARS-CoV-2 Strain Surveillance (NS3) programa nazionalaetxeko SARS-CoV-2ren ordezkaritza hobetzekosekuentziak.Programak AEBko 64 publikorekin elkarlanean aritzen daosasun-laborategiak zaintza genomikoaren sistema bati laguntzeko;NS3 SARS-CoV-2 aleen bilduma bat ere eraikitzen ari da and sekuentziak osasun publikoaren erantzuna eta zientifikoa laguntzekomutazioek duten eragina ebaluatzeko ikerketaklehendik dauden gomendatutako medikuen aurkako neurriak.CDCk dituhainbat lan kliniko komertzial handirekin ere kontratatuatoriek hamarnaka milaka SARS-CoV-2 azkar sekuentziatzekoale positiboak hilero eta zazpi akademiko finantzatu dituerakundeek lankidetzan zaintza genomikoa egitekoosasun publikoko agentziekin, eta, horrela, nabarmen gehituzzaintza genomikoaren datu puntualak eskura izateaAmeriketako Estatu Batuak.Ekimen nazional horiez gain,Estatuko eta tokiko osasun publikoko agentzia asko sekuentziatzen ari dira

1. IRUDIA. Uneko SARS-CoV-2 aldaeren eta B.1.1.7 aldaeraren kasuen intzidentzia-ibilbide simulatuak*,komunitateko txertorik ez hartuzeta hasierako R t = 1,1 (A) edo hasierako R t = 0,9 (B) egungo aldaeretarakoEstatu Batuak, urtarrila2021eko apirila

 

1. irudia
2. irudia
laburdurak
1. irudia

SARS-CoV-2 tokiko epidemiologia hobeto ulertzeko etaosasun publikoaren erantzuna babestea pandemiari.Txosten honetako aurkikuntzak gutxienez hiru mugaren menpe daudetazioak.Lehenik eta behin, transmisibaren handitzearen magnitudeaEstatu Batuetan ikusitakoarekin alderatutaErresuma Batua ez dago argi.Bigarrena, ren prebalentziaEstatu Batuetan B.1.1.7 ere ezezaguna da momentu honetan, bainaaldaeren detekzioa eta prebalentziaren estimazioa hobetuko daAEBetako zaintza-esfortzu handiekin.Azkenik, tokiko mitiganeurriak ere oso aldakorrak dira, eta horrek aldakuntza eragiten duR t .Hemen aurkezten diren emaitza zehatzak simulan oinarritzen diraeta aringarrietan aldaketarik ez zuela suposatu urtarrilaren 1etik aurrera.B.1.1.7 aldaeraren gerraren transmisigarritasuna areagotzeaosasun publikoko estrategiak zorrotz ezartzea eskatzen dutransmisioa murriztea eta B.1.1.7ren balizko eragina murriztea,txerto-estaldura handitzeko denbora kritikoa erostea.CDC-akereduzko datuek erakusten dute erabilera unibertsala eta compliarintzeko neurriak eta txertoa hartzea funtsezkoak dirakasu berrien eta heriotza kopurua nabarmen murrizteadatozen hilabeteak.Gainera, ez duten pertsonen proba estrategikoakCOVID-19aren sintomak, baina arrisku handiagoa dutenakSARS-CoV-2 infekzioak beste aukera bat eskaintzen duetengabeko hedapena mugatzea.Kolektiboki, zaintza genomiko hobetualantza osasun publikoa betetzea areagotzearekin bateraarintzeko estrategiak, txertoa barne, distantzia fisikoamaskarak erabiltzea, eskuen higienea eta isolamendua eta berrogeialdia,ezinbestekoa izango da SARS-CoV-2 hedapena mugatzeko etaosasun publikoa babestea.

Eskerrak

Osasun Publikoko Larrialdietarako Sekuentziazioko kideakErantzuna, Epidemiologia eta Zaintza partzuergoa;estatukoak eta tokikoakosasun publikoko laborategiak;Osasun Publikoko Laborategien Elkartea;CDC COVID-19 Erantzun Taldea;Arnas birusen adarra,Gaixotasun Biralen Dibisioa, CDC.Mediko Aldizkarien Editoreen Batzordearen inprimakia potentzialaren berri emateko.interes-gatazkak.Ez zen balizko interes-gatazkarik azaldu.

Erreferentziak

1. Osasun Publikoa Ingalaterra.SARS-CoV-2 aldaera eleberriaren ikerketa: kezkaren aldaera 202012/01, informazio teknikoa 3. Londres, Erresuma Batua: Public Health England;2020. https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/950823/Variant_of_Concern_VOC_202012_01_Technical_Briefing_3_-_England.pdf
2. Kemp SA, Harvey WT, Datir RP, et al.ΔH69/V70 SARS-CoV-2 erpinaren ezabaketa errepikakorren agerpena eta transmisioa.bioRxiv[Preprint sarean argitaratua 2021eko urtarrilaren 14an].https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.14.422555v4
3. Volz E, Mishra S, Chand M, et al.SARS-CoV-2 leinuaren B.1.1.7 transmisioa Ingalaterran: datu epidemiologikoak eta genetikoak lotzeko ikuspegiak.medRxiv [Preprint sarean argitaratua 2021eko urtarrilaren 4an].https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.30.20249034v2
4. Honein MA, Christie A, Rose DA, et al.;CDC COVID-19 Erantzun Taldea.SARS-CoV-2 eta erlazionatutako heriotzen komunitatearen transmisio maila altuei aurre egiteko osasun publikoko estrategien orientabideen laburpena, 2020ko abendua. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2020;69:1860–7.PMID:33301434 https://doi.org/10.15585/mmw9e2mm.
5. Volz E, Hill V, McCrone JT, et al.;COG-UK Partzuergoa.D614G SARS-CoV-2 piko mutazioaren eraginak ebaluatzea transmisigarritasunean eta patogenikotasunean.Cell 2021;184:64–75.e11.PMID:33275900 https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.11.020
6. Korber B, Fischer WM, Gnanakaran S, et al.;Sheffield COVID-19 Genomics Group.SARS-CoV-2 puntuko aldaketen jarraipena: D614G-k COVID-19 birusaren infektibitatea areagotzen duela frogatzen du.Zelula
2020;182:812–27.PMID:32697968 https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.043
7. McCarthy KR, Rennick LJ, Namnulli S, et al.SARS-CoV-2 puntako glikoproteinaren ezabatze naturalek antigorputzak ihes egiten dute.bioRxiv [Preprint sarean argitaratua 2020ko azaroaren 19an].https://www.biorxiv.org/content/
10.1101/2020.11.19.389916v18.Washington NL, White S, Schiabor KM, Cirulli ET, Bolze A, Lu JT.S genea uzteko ereduek SARS-CoV-2 probetan H69del/V70del mutazioa hedatzea iradokitzen dute AEBetan.medRxiv [Preprint sarean argitaratua 2020ko abenduaren 30ean].https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.24.20248814v1
9. Weisblum Y, Schmidt F, Zhang F, et al.SARS-CoV-2 spike proteinaren aldaerek antigorputz neutralizatzaileetatik ihes egin.eLife 2020;9:e61312.PMID:33112236 https://doi.org/10.7554/eLife.61312
10. Greaney AJ, Loes AN, Crawford KHD, et al.Giza serumaren antigorputz poliklonalen aitorpena eragiten duten SARS-CoV-2 hartzaileari lotzeko domeinuko mutazioen mapa integrala.bioRxiv [Preprint sarean argitaratua 2021eko urtarrilaren 4an].https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.31.425021v1


Argitalpenaren ordua: 2021-02-11