Foreasy Taq DNA Polimerasa
Deskribapena
Foreasy Taq DNA Polimerasa Escherichia coli ingeniaritza bakterioetan adierazten den Taq entzima berri bat da, gene birkonbinazio teknologiaren bidez.Entzimak berak hot-start jarduera jakin bat du eta ohiko PCR eta qPCR egiteko erabil daiteke;5'→3' DNA polimerasa jarduera eta 5'→3' exonukleasa jarduera ditu, baina ez 3'→5' exonukleasa jarduerarik.
Kitaren osagaiak
Osagaia | IM-01011 | IM-01012 | IM-01013 |
Foreasy Taq DNA Polimerasa(5 U/μL) | 5000 U (1 ml) | 50 KU (10 ml) | 500 KU (100 ml) |
2× Taq Erreakzio Buffer | 25 ml × 5 | 250 ml × 5 | 500 ml × 25 |
Ezaugarriak eta abantailak
- Espezifikotasun handia: entzimak abiarazte beroko jarduera jakin bat du.
- Anplifikazio azkarra: 10 seg/kb.
- Oso moldagarria den txantiloia: GC modu eraginkorrean anplifikatzeko erabil daiteke. Balio handiko eta anplifikatzeko zailak diren hainbat DNA txantiloi.
- Fideltasun handia: Taq Entzima arrunta 6 aldiz.
- Egonkortasun termiko handia: astebetez 37 °C-tan jar daiteke eta % 90 baino gehiagoko jarduera mantentzen du
Kit aplikazioa
Hainbat PCR/qPCR sistema eta zuzeneko PCR sistema
DNA zatien PCR anplifikazioa
DNA etiketatzea
DNAren sekuentziazioa
PCR A-buztan
U Definizioa
1U: 10 nmol desoxinukleotido txertatzeko behar den entzima-kopurua azidoan disolbaezin den materian izokin-espermaren DNA aktibatua erabiliz txantiloi/primatzaile gisa 30 minutuz 74 °C-tan.
Erreakzio Baldintza
Tenperatura | Denbora | Zikloa |
37°C | 5min | 1 |
94°C | 5min | 1 |
94°C | 10 segundo | 35 |
60°C | 10 segundo | |
72°C | 20 seg/kb | |
72°C | 2min | 1 |
Biltegiratzea
-20 ± 5 °C 2 urtez edo -80 °C-tan epe luzerako biltegiratzeko.
Anplifikazio seinalerik ez
1.Kitaren Taq DNA Polimerasak bere jarduera galtzen du kitaren biltegiratze desegokiagatik edo iraungitzeagatik.
Gomendioa: berretsi kitaren biltegiratze-baldintzak;gehitu berriro Taq DNA polimerasa kopuru egoki bat PCR sistemara edo erosi denbora errealeko PCR kit berri bat erlazionatutako esperimentuetarako.
2.ADN txantiloian Taq DNA Polimerasaren inhibitzaile asko daude.
Iradokizuna: txantiloia birraztu edo erabilitako txantiloi kopurua murriztu.
3.Mg2+ kontzentrazioa ez da egokia.
Gomendioa: eskaintzen dugun 2× Real PCR Mixaren Mg2+ kontzentrazioa 3,5 mM da.Hala ere, lehen eta txantiloi berezi batzuetarako, Mg2+ kontzentrazioa handiagoa izan daiteke.Hori dela eta, zuzenean MgCl2 gehi dezakezu Mg2+ kontzentrazioa optimizatzeko.Optimizatzeko aldi bakoitzean Mg2+ 0.5mM handitzea gomendatzen da.
4.PCR anplifikazio-baldintzak ez dira egokiak, eta primer-sekuentzia edo kontzentrazioa desegokia da.
Iradokizuna: berretsi abiarazlearen sekuentziaren zuzena eta abiarazlea ez dela degradatu;anplifikazio-seinalea ona ez bada, saiatu erretiro-tenperatura jaisten eta lehen-kontzentrazioa egoki egokitzen.
5. Txantiloi kopurua gutxi edo gehiegi da.
Gomendioa: Egin txantiloiaren linealizazio-gradientearen diluzioa eta hautatu denbora errealeko PCR esperimenturako PCR efektu onena duen txantiloiaren kontzentrazioa.
NTC fluoreszentzia balio handiegia du
1.Erreaktiboen kutsadura funtzionamenduan eragindakoa.
Gomendioa: Ordeztu denbora errealeko PCR esperimentuetarako erreaktibo berriekin.
2.PCR erreakzio-sistema prestatzerakoan kutsadura gertatu da.
Gomendioa: Hartu behar diren babes-neurriak funtzionatzerakoan, hala nola: latexezko eskularruak jantzita, iragazkidun pipeta-punta erabiltzea, etab.
3.Primerak degradatu egiten dira, eta abiarazleak degradatzeak anplifikazio ez-espezifikoa eragingo du.
Iradokizuna: Erabili SDS-PAGE elektroforesia abiarazleak degradatuta dauden ala ez detektatzeko, eta ordeztu lehengai berriekin Denbora errealeko PCR esperimentuetarako.
Primer dimeroa edo anplifikazio ez-espezifikoa
1.Mg2+ kontzentrazioa ez da egokia.
Gomendioa: eskaintzen dugun 2× Real PCR EasyTM Mixaren Mg2+ kontzentrazioa 3,5 mM da.Hala ere, lehen eta txantiloi berezi batzuetarako, Mg2+ kontzentrazioa handiagoa izan daiteke.Hori dela eta, zuzenean MgCl2 gehi dezakezu Mg2+ kontzentrazioa optimizatzeko.Optimizatzeko aldi bakoitzean Mg2+ 0.5mM handitzea gomendatzen da.
2.PCR annealing tenperatura baxuegia da.
Iradokizuna: handitu PCR errekostatzeko tenperatura 1 ℃ edo 2 ℃ bakoitzean.
3.PCR produktua luzeegia da.
Gomendioa: Denbora errealeko PCR produktuaren iraupena 100-150 bp artekoa izan behar du, ez 500 bp baino gehiago.
4.Primerak degradatu egiten dira, eta abiarazleen degradazioak anplifikazio espezifikoa agertzea ekarriko du.
Iradokizuna: Erabili SDS-PAGE elektroforesia abiarazleak degradatuta dauden ala ez detektatzeko, eta ordeztu lehengai berriekin Denbora errealeko PCR esperimentuetarako.
5.PCR sistema desegokia da, edo sistema txikiegia da.
Iradokizuna: PCR erreakzio-sistema txikiegia izateak detekzio-zehaztasuna gutxituko du.Hobe da PCR kuantitatiboko tresnak gomendatutako erreakzio-sistema erabiltzea Real Time PCR esperimentua berriro exekutatzeko.
Balio kuantitatiboen errepikakortasun eskasa
1. Tresna gaizki funtzionatzen ari da.
Iradokizuna: akatsak egon daitezke tresnaren PCR zulo bakoitzaren artean, tenperaturaren kudeaketan edo detekzioan erreproduzigarritasun eskasa eraginez.Mesedez, egiaztatu dagokion tresnaren argibideen arabera.
2.Laginaren garbitasuna ez da ona.
Gomendioa: lagin ezgabeek esperimentuaren erreproduzigarritasun eskasa ekarriko dute, txantiloiaren eta lehengaien purutasuna barne.Hobe da txantiloia birraztea, eta lehengaiak SDS-PAGE bidez garbitzen dira.
3.PCR sistema prestatzeko eta biltegiratzeko denbora luzeegia da.
Iradokizuna: Erabili denbora errealeko PCR sistema PCR esperimenturako prestatu eta berehala, eta ez utzi denbora luzez alde batera utzita.
4.PCR anplifikazio-baldintzak ez dira egokiak, eta primer-sekuentzia edo kontzentrazioa desegokia da.
Iradokizuna: berretsi abiarazlearen sekuentziaren zuzena eta abiarazlea ez dela degradatu;anplifikazio-seinalea ona ez bada, saiatu erretiro-tenperatura jaisten eta lehen-kontzentrazioa egoki egokitzen.
5.PCR sistema desegokia da, edo sistema txikiegia da.
Iradokizuna: PCR erreakzio-sistema txikiegia izateak detekzio-zehaztasuna gutxituko du.Hobe da PCR kuantitatiboko tresnak gomendatutako erreakzio-sistema erabiltzea Real Time PCR esperimentua berriro exekutatzeko.